[Cours] Bactériologie Exclusive

Table des matières
Chapitre 1 - Anatomie fonctionnelle des bactéries
1.1 La découverte du monde bactérien
1.2 L'anatomie des bactéries
1.2.1 L'appareil nucléaire des bactéries
1.2.2 L'ADN extra-chromosomique
1.2.2.1 Le facteur sexuel ou facteur F
1.2.2.2 Les plasmides de résistance aux antibiotiques (ou facteurs R)
1.2.2.3 Les autres plasmides
1.2.3 Le cytoplasme bactérien
1.2.4 La membrane cytoplasmique
1.2.4.1 La membrane cytoplasmique, ou membrane interne
1.2.4.2 Fonctions principales de la membrane cytoplasmique
1.2.4.3 Certaines substances antibactériennes affectent la membrane cytoplasmique
1.2.5 La paroi bactérienne
1.2.5.1 Structure du peptidoglycane
1.2.5.2 Différences entre bactéries à Gram positif et à Gram négatif
1.2.5.3 Rôle de la paroi
1.2.6 Structures inconstantes
1.2.6.1 La capsule
1.2.6.2 Cils ou flagelles
1.2.6.3 Les pili ou fimbriae
1.2.6.4 Les spores
1.2.6.5 Le glycocalyx
Chapitre 2 - Génétique bactérienne
2.1 Variations génétiques par mutation
2.1.1 Caractères de la mutation bactérienne
2.1.2 La mutation à l'échelon moléculaire
2.2 Les variations génétiques par transfert de matériel génétique
2.2.1 La transformation
2.2.2 La conjugaison
2.2.2.1 Mise en évidence de la conjugaison
2.2.2.2 Caractères de la conjugaison
2.2.2.3 Conclusions
2.2.3 Les plasmides
2.2.3.1 Mise en évidence
2.2.3.2 Propriétés biologiques portées par les plasmides
2.2.3.3 Conclusion
2.2.4 La transposition - Les transposons
2.2.4.1 Mise en évidence de la transposition
2.2.4.2 Propriétés des transposons
2.2.4.3 Structure des transposons
2.2.4.4 Conclusion
2.2.5 La transduction
2.2.5.1 Caractères de la transduction
2.2.5.2 Conclusions
Chapitre 3 - Staphylocoques
3.1 Définition
3.2 Historique
3.3 Habitat
3.4 Pouvoir pathogène
3.4.1 Caractères généraux
3.4.2 Infections staphylococciques
3.5 Etude bactériologique
3.5.1 Microscope
3.5.2 Culture
3.5.3 Caractères biochimiques
3.5.4 Facteurs de virulence de physiopathologie
3.5.4.1 Les composants de la paroi
3.5.4.2 Facteurs d'invasion et d'adhésion
3.5.4.3 Substances élaborées par S.aureus
3.6 Diagnostic bactériologique
3.7 Les bases du traitement
3.7.1 Traitement préventif
3.7.2 Traitement curatif
Chapitre 4 - Les streptocoques, entérocoques et pneumocoques
4.1 Les streptocoques
4.1.1 Historique
4.1.2 Habitat
4.1.3 Pouvoir pathogène
4.1.3.1 Maladies provoquées par les streptocoques des groupes A, C, G.
4.1.3.2 Maladies provoquées par les autres streptocoques
4.1.4 Etude bactériologique
4.1.4.1 Microscope
4.1.4.2 Culture
4.1.4.3 Caractères biochimiques
4.1.4.4 Structure antigénique
4.1.4.5 Substances élaborées par streptococcus pyogènes
4.1.5 Diagnostic bactériologique
4.1.5.1 Diagnostic direct
4.1.5.2 Diagnostic indirect
4.1.6 Traitement
4.1.6.1 Traitement curatif
4.1.6.2 Traitement préventif
4.2 Les entérocoques
4.3 Le pneumocoque
4.3.1 Définition
4.3.2 Habitat
4.3.3 Pouvoir pathogène naturel
4.3.4 Etude bactériologique
4.3.4.1 Microscope
4.3.4.2 Culture
4.3.4.3 Caractères biochimiques
4.3.4.4 Construction chimique et antigènique
4.3.4.5 Pouvoir pathogène expérimental
4.3.5 Diagnoctic bactériologique
4.3.6 Traitement
4.4 Bibliographie
Chapitre 5 - Les neisseria
5.1 Nesséria méningitidis
5.1.1 Habitat
5.1.2 Epidémiologie et pouvoir pathogène
5.1.3 Etude bactériologique
5.1.3.1 Microscope
5.1.3.2 Culture
5.1.3.3 Caractères biochimiques
5.1.3.4 Structure chimique et antigènique
5.1.4 Diagnostic bactériologique
5.1.5 Traitement
5.1.5.1 Traitement curatif
5.1.5.2 Traitement préventif
5.2 Neisseria gonorrhoeae
5.2.1 Habitat
5.2.2 Pouvoir pathogène
5.2.3 Etude bactériologique
5.2.3.1 Microscope
5.2.3.2 Culture
5.2.3.3 Caractères biochimiques
5.2.3.4 Structure chimique et antigènique
5.2.4 Diagnostic bactériologique
5.2.4.1 Diagnoctic direct
5.2.4.2 Diagnostic indirect
5.2.5 Traitement
5.2.5.1 Traitement curatif
5.2.5.2 Prévention
5.3 Réferences
Chapitre 6 - Les bacilles à gram positif non sporules
6.1 Corynebactérium diphteriae
6.1.1 Historique
6.1.2 Habitat
6.1.3 Pouvoir pathogène
6.1.3.1 Physiopathalogie
6.1.3.2 Clinique
6.1.4 Bactériologie
6.1.4.1 Microscope
6.1.4.2 Culture
6.1.4.3 Caractères biochimiques
6.1.4.4 Structure antigènique et substances élaborées
6.1.5 Diagnostic bactériologique
6.1.6 Traitement
6.1.6.1 Traitement curatif
6.1.6.2 Traitement préventif
6.2 Listéria monocytogènes
6.2.1 Habitat
6.2.2 Facteurs de virulence et physiopathologie
6.2.3 Pouvoir pathogène
6.2.3.1 Pouvoir pathogène naturel
6.2.3.2 Pouvoir pathogène expérimental
6.2.4 Caractères bactériologiques et antigéniques
6.2.5 Diagnostic bactériologique
6.2.6 Traitement
Chapitre 7 - Entérobactéries et autres bacilles à gram négatif non exigeants
7.1 Les entérobactéries
7.1.1 Caractères généraux et classification des entérobactéries
7.1.1.1 Définition des entérobactéries
7.1.1.2 Répartition en genres
7.1.1.3 Caractérisation des espèces
7.1.2 Salmonella
7.1.2.1 Définition et habitat
7.1.2.2 Classification
7.1.2.3 Pouvoir pathogène naturel
7.1.3 Shigella
7.1.3.1 Définition
7.1.3.2 Le pouvoir pathogène
7.1.3.3 Etude bactériologique
7.1.3.4 Diagnostic bactériologique
7.1.3.5 Traitement
7.1.4 Yersinia
7.1.4.1 Yersinia pestis
7.1.4.2 Yersinia entérocolitica et pseudotuberculosis
7.1.5 Escherichia coli
7.1.5.1 Définition
7.1.5.2 Habitat
7.1.5.3 Pouvoir pathogène
7.1.5.4 Diagnostic bactériologique
7.1.5.5 Traitement
7.1.6 Autres entérobactéries commensales
7.1.6.1 Proteus mirabilis
7.1.6.2 Klebsiella
7.1.7 Entérobactéries saprophytes
7.2 Les autres bacilles à gram négatif aerobies non exigeants
7.2.1 Les bacilles à gram négatif des genres pseudomonas et acinetobacter
7.2.1.1 Pseudomonas
7.2.1.2 Acinetobacter
7.2.2 Vibrio cholerae
7.2.2.1 Definition
7.2.2.2 Habitat
7.2.2.3 Pouvoir pathogène
7.2.2.4 Bactériologie
7.2.2.5 Diagnostic microbiologique
7.2.2.6 Traitement
Chapitre 8 - Les bacilles a gram positif sporules
8.1 Bacilles aerobies sporules
8.1.1 Bacillus anthracis
8.1.1.1 Pouvoir pathogène naturel de B.anthracis
8.1.1.2 Bactériologie
8.1.1.3 Diagnostic
8.1.1.4 Traitement
8.2 Bacilles anaérobies sporules
8.2.1 Caractères généraux des bactéries du genre clostridium
8.2.2 Clostridium botulinum
8.2.2.1 Habitat
8.2.2.2 Pouvoir pathogène naturel
8.2.2.3 Caractères bactériologiques
8.2.2.4 La toxine botulinique
8.2.2.5 Diagnostic
8.2.2.6 Traitement
8.2.3 Clostridium tétani
8.2.3.1 Habitat
8.2.3.2 Pouvoir pathogène naturel
8.2.3.3 Caractères bactériologiques
8.2.3.4 La toxine tétanique
8.2.3.5 Diagnostic
8.2.3.6 Traitement
8.2.4 Clostridia de la gangrène gazeuse
8.2.4.1 Habitat de Clostridium perfringens
8.2.4.2 Pouvoir pathogène naturel de C.perfringens
8.2.4.3 Caractères bactériologiques de C.perfringens
8.2.4.4 Diagnostic
8.2.4.5 Traitement
8.2.5 Les colites pseudomembraneuses provoquées par les clostridia
Chapitre 9 - Les bacilles à gram négatif hémophiles ou exigeants
9.1 Genre géemophilus
9.1.1 Caractères généraux
9.1.2 Haémophilus influenzae
9.1.2.1 Habitat
9.1.2.2 Pouvoir pathogène
9.1.2.3 Etude bactériologique
9.1.2.4 Diagnostic bactériologique
9.1.2.5 Traitement
9.1.3 Autres haemophilus
9.2 Genre bordetella
9.2.1 Bordetella pertussis
9.2.1.1 Habitat
9.2.1.2 Pouvoir pathogène
9.2.1.3 Etude bactériologique
9.2.1.4 Diagnostic bactériologique
9.2.1.5 Traitement
9.3 Genre brucella
9.3.1 Définition
9.3.2 Habitat
9.3.3 Pouvoir pathogène naturel
9.3.3.1 Chez l'animal
9.3.3.2 Chez l'homme
9.3.4 Diagnostic
9.3.4.1 Le diagnostic direct
9.3.4.2 Le diagnostic indirect
9.3.5 Traitement
9.3.5.1 Le traitement préventif
9.3.5.2 Le traitement curatif
Chapitre 10 - La flore microbienne normale de l'organisme
Chapitre 11 - Les spirochetes
11.1 Genre treponema
11.1.1 La maladie syphilitique
11.1.1.1 L'incubation
11.1.1.2 La lésion primaire
11.1.1.3 Lésions secondaires
11.1.1.4 Evolution
11.1.1.5 La syphilis congénitale
11.1.2 Bactériologie
11.1.2.1 Morphologie
11.1.2.2 Culture
11.1.2.3 Structure antigénique
11.1.2.4 Pouvoir pathogène expérimental
11.1.3 Diagnostic biologique
11.1.3.1 Les prélèvements
11.1.3.2 La recherche du tréponème
11.1.3.3 Le sérodiagnostic
11.1.4 Traitement
11.2 Borrelia
11.3 Les leptospira
Chapitre 12 - Mycobactéries
12.1 Mycobacterium tuberculosis
12.1.1 Historique
12.1.2 Habitat
12.1.3 Pouvoir pathogène
12.1.3.1 Physiopathologie
12.1.3.2 Clinique
12.1.4 Etude bactériologique
12.1.4.1 Microscope
12.1.4.2 Culture
12.1.4.3 Caractères biochimiques
12.1.4.4 Constitution chimique et antigénique
12.1.4.5 Génétique
12.1.4.6 Résistance aux agents physiques et chimiques
12.1.5 Pouvoir pathogène expérimental. Le phénomène de Koch
12.1.6 Diagnostic bactériologique
12.1.6.1 Diagnostic direct
12.1.6.2 Diagnostic indirect
12.1.7 Traitement
12.1.7.1 Traitement curatif
12.1.7.2 Traitement préventif
12.2 Mycobacterium bovis
12.3 Mycobacterium africanum
12.4 Mycobactéries atypiques
12.5 Mycobactérium leprae
Chapitre 13 - Les rickettsia et bactéries voisines
13.1 Définition
13.2 Historique
13.3 Bactériologie
13.3.1 Les rickettsia : classification
13.3.2 Les caractères généraux des rickettsies
13.3.2.1 Ce sont des bactéries
13.3.2.2 Morphologie
13.3.2.3 Constitution chimique
13.3.2.4 Vitalité, résistance
13.3.2.5 Structure antigénique
13.3.2.6 Culture
13.4 Pouvoir pathogène chez l'homme
13.4.1 Bases du pouvoir pathogène
13.4.2 Les différentes rickettsioses humaines
13.4.2.1 Groupe du typhus épidémique
13.4.2.2 Groupe des fièvres pourprées
13.4.2.3 Groupe des typhus tropicaux
13.4.2.4 Autres infections proches des rickettsioses
13.4.2.5 Les infections humaines à Ehrlichia
13.5 Diagnostic des rickettsioses
13.6 Traitement des rickettsioses
Chapitre 14 - Les chlamydia
14.1 Caractères généraux des chlamydia
14.2 Chlamydia trachomatis
14.2.1 Le trachome
14.2.2 Les infections génitales ou sexuellement transmissibles
14.2.3 Lymphogranulomatose vénérienne ou maladie de Nicolas et Favre
14.2.4 Diagnostic bactériologique
14.2.5 Traitement
14.3 Chlamydia psittaci
14.3.1 Le réservoir de germes
14.3.2 Le pouvoir pathogène
14.3.3 Diagnostique bactériologique
14.3.4 Traitement
14.4 Chlamydia pneumoniae
14.4.1 Réservoir de germes
14.4.2 Pouvoir pathogène
14.4.3 Diagnostic bactériologique
14.4.4 Traitement

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